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對于培養(yǎng)細胞樣品:
1.融解RIPA裂解液,混勻。取適當量的裂解液,在使用前數(shù)分鐘內(nèi)加入PMSF,使PMSF的zui終濃度為1mM。
2.對于貼壁細胞:去除培養(yǎng)液,用PBS、生理鹽水或無血清培養(yǎng)液洗一遍(如果血清中的蛋白沒有干擾,可以不洗)。按照6孔板每孔加入150-250微升裂解液的比例加入裂解液。用槍吹打數(shù)下,使裂解液和細胞充分接觸。通常裂解液接觸細胞1-2秒后,細胞就會被裂解。
對于懸浮細胞:離心收集細胞,用手指把細胞用力彈散。按照6孔板每孔細胞加入150-250微升裂解液的比例加入裂解液。再用手指輕彈以充分裂解細胞。充分裂解后應沒有明顯的細胞沉淀。如果細胞量較多,必需分裝成50-100萬細胞/管,然后再裂解。
3.充分裂解后,10000-14000g離心3-5分鐘,取上清,即可進行后續(xù)的PAGE、Western和免疫沉淀等操作。
裂解液用量說明:通常6孔板每孔細胞加入150微升裂解液已經(jīng)足夠,但如果細胞密度非常高可以適當加大裂解液的用量到200微升或250微升。
在試驗中,不同的細胞采用不同的裂解方法。如研磨,細胞勻漿,TritonX--100,稀減法等等。那么,具體該怎樣選擇細胞的裂解方法?本節(jié)內(nèi)容主要圍繞組織樣本裂解細胞的方法做詳細介紹。
1.把組織剪切成細小的碎片。
2.融解RIPA裂解液,混勻。取適當量的裂解液,在使用前數(shù)分鐘內(nèi)加入PMSF,使PMSF的zui終濃度為1mM。
3.按照每20毫克組織加入150-250微升裂解液的比例加入裂解液。(如果裂解不充分可以適當添加更多的裂解液,如果需要高濃度的蛋白樣品,可以適當減少裂解液的用量。)
4.用玻璃勻漿器勻漿,直至充分裂解。
5.充分裂解后,10000-14000g離心3-5分鐘,取上清,即可進行后續(xù)的PAGE、Western和免疫沉淀等操作。
6.如果組織樣品本身非常細小,可以適當剪切后直接加入裂解液裂解,通過強烈vortex使樣品裂解充分。然后同樣離心取上清,用于后續(xù)實驗。直接裂解的優(yōu)點是比較方便,不必使用勻漿器,缺點是不如使用勻漿器那樣裂解得比較充分。
注:RIPA裂解液的裂解產(chǎn)物中經(jīng)常會出現(xiàn)一小團透明膠狀物,屬正常現(xiàn)象。該透明膠狀物為含有基因組DNA等的復合物。在不檢測和基因組DNA結合特別緊密的蛋白的情況下,可以直接離心取上清用于后續(xù)實驗;如果需要檢測和基因組結合特別緊密的蛋白,則可以通過超聲處理打碎打散該透明膠狀物,隨后離心取上清用于后續(xù)實驗。如果檢測一些常見的轉錄因子,例如NF-kappaB、p53等時,通常不必進行超聲處理,就可以檢測到這些轉錄因子。